Analys av biologiska data

Mål

Kursens mål är att ge grundläggande färdigheter i att använda moderna beräkningsverktyg för att analysera och visualisera biologiska data. Efter genomgången kurs ska studenten kunna:

• Självständigt hantera stora biologiska dataset i ett syntax-baserat programspråk.
• Förstå strukturen hos olika filformat som vanligtvis används för att lagra data, och läs in sådan data för vidare analys.
• Manipulera och analysera data med metoder som statistiska modeller, för att lösa biologiska problem.
• Visualisera biologiska data i enighet med god vetenskaplig praxis.

Innehåll

Kursen är uppbyggd kring det arbetsflöde som sträcker sig från rådata till presentationsfärdigt analysresultat. Kursen behandlar principer för och tillämpning av syntax för analys av biologiska data med bl.a. statistiska verktyg. Kursen går också igenom visualiseringsmetoder lämpade för olika ändamål, bland annat histogram, density plots, scatterplots mm. Kursen presenterar vidare vikten av analys av stora biologiska dataset och den roll detta spelar inom modern biologisk forskning.