Molekylär bildbehandling och digital patologi

Mål

Kunskap och förståelseEfter avslutad kurs förväntas studenten kunna:

• Redogöra för grundläggande preparationsmetoder för vävnad, celler och små organismer för olika mikroskopitekniker inom ljus-, fluorescens- och elektronmikroskopi
• Redogöra för skillnaden mellan olika mikroskopitekniker och beskriva deras fördelar och nackdelar.
• Redogöra för hur en digital bild erhålles och vad en digital bild innebär, samt beskriva fördelar och nackdelar med vedertagna bildbehandlingsprocesser.
• Redogöra för centrala begrepp och principer gällande vedertagna bildjusteringar och -analyser samt risker i samband med digital bildbehandling
• Beskriva hur olika mikroskopitekniker och bildanalysmetoder kan användas för att bedöma sjukdomstillstånd.

Färdighet och förmågaEfter avslutad kurs förväntas studenten kunna:

• Föreslå en relevant preparationsteknik och mikroskopimetod för att lösa en given vetenskaplig frågeställning.
• Använda ljus-, fluorescens-, och elektronmikroskopering korrekt för studier av både levande och fixerat biologiskt material.
• Tillämpa mjukvarubaserad bildbehandling för analys av digitala bilder på en grundläggande nivå.

Värderingsförmåga och förhållningssättEfter avslutad kurs förväntas studenten kunna:

• Reflektera över möjligheter och begränsningar hos olika mikroskopitekniker, provpreparation och digitala bilder vid analys av vävnad, celler och små organismer.
• Kritiskt granska och värdera tillförlitligheten av bildbaserade mikroskopiresultat, både i råformat och efter digital bildbehandling

Innehåll

Kursen ger en introduktion till olika avbildningstekniker inom forskning och sjukvård som ska ge studenterna en grundläggande förmåga att bedöma och förmedla resultat från bildbehandlingsbaserade undersökningar och föreslå mikroskopimetoder lämpliga för olika frågeställningar.

Studenterna skall få kunskap om provpreparation av vävnad, celler och små organismer, framtagandet av digitala bilder och centrala begrepp i bildbehandling riktad till studenter inom biologisk/medicinsk vetenskap. Kursen ger studenten teoretisk och praktisk kunskap för att förstå både basala och avancerade mikroskopieringstekniker och hur dessa tekniker lämpligen används för att lösa olika slags vetenskapliga frågeställningar. Digitala bildbehandlingsmetoder kommer också användas för studier av biologiska prover. Kursen kommer specifikt inkludera olika tekniker och metoder för mikroskopering på olika strukturella nivåer (ljus-, fluorescens-, och elektronmikroskopiering) samt digital analys av vävnad, celler och modellorganismer.

Kursen omfattar ämnesområdena fysiologi, anatomi, patologi, medicinsk bildanalys/-vetenskap samt molekylär biologi och cellbiologi som integreras med biomedicinsk laboratorieteknik, biomedicinsk etik och vetenskapligt förhållningssätt.